Hola,
Es que son dos cosas diferentes.
Si lo que dices es que esta chica ahora ha generado antigüedad, pues se la debes poner.
El concepto "a cuenta convenio" es para atrasos, que no es el caso.
Otra cosa es que la empresa quiera reducir ese concepto de a cuenta convenio y luego cuando salgan atrasos pague lo que tenga que pagar, pero si ahora esa chica ha conseguido antigüedad, pues se la debes poner.