Tendrás que hacer una variación de datos del autónomo en la seguridad social, cese como socio/miembro del órgano de administración de la sociedad y comienzo de la nueva actividad
La variación de datos se hace con un ta0521 y a lo mejor es conveniente que añadas un pequeño escrito explicando el cambio, a mi depende del funcionario que me atienda me lo piden o no, a unos les gusta más el papel que a otros.
Lo que si tendrás que presentar es la justificación del cambio, es decir el alta en hacienda de la nueva actividad como persona física y la baja en hacienda de la actividad de la empresa, si hay escritura de liquidación, o al menos la firma del otro socio en el 0521 declarando el cese de servicios en la sociedad.