Buenos días,
En mi caso, siempre que he tenido una Baja por accidente de trabajo de un Autónomo, siempre he enviado Delta, porque así me indicaban desde la Mutua.
Creo que es indiferente tener marcada NO cotización por esta contingencia. Existe accidente de trabajo, y hay que detallarlo en el Delta.
(ánimo, el Delta siempre da repelús, con tanto y tanto desplegable, pero una vez te pones, te lo ventilas rápido)