Bueno, más que recuperar, la opción razonable, si se trata de un permiso no retribuido (porque el convenio no lo reconozca expresamente como retribuido y dado que, de forma general el ET no lo hace) sería descontar el salario y otros devengos correspondientes a ese dia.
O si empresa y trabajador están de acuerdo, imputar ese tiempo a cuenta de vacaciones.
Peor si ambos están de acuerdo, otra opción puede ser recuperar ese tiempo, claro.
Saludos