Ante todo, paciencia ;D
Te pego aqui lo que debes hacer
http://www.bizkaia.net/home2/Temas/DetalleTema.asp?Tem_Codigo=5163&idioma=CA&dpto_biz=5&codpath_biz=5
Primero tienes que firmar una adhesion con algun colegio o asociacion que haya firmado convenio con la Diputacion Foral (aproximadamente 1-2 semanas)
Despues, tramitas el alta del cliente, le mandan unas claves al domicilio social y ya ahí, puedes presentar los impuestos
Saludos