Qué significa eso que cuando voy al trabajador sigue de baja...
Si vas a eliminar nóminas no tiene nada que ver con la baja del trabajador.
Pon la empresa, el trabajador, nóminas desde 01/06/2013 hasta 30/06/2013 para eliminar junio, o 01/07/2013 hasta 31/07/2013 para eliminar julio, además elije en la pestaña, si quieres eliminar nómina, finiquitos, atrasos, etc.. si está finiquitado si no, es muy fácil, y te la elimina, si no es así es que a lo mejor no tienes ninguna nómina que eliminar