Entiendo que se refiere a todo tipo de empresas, incluidos los autónomos persona física, pues no veo ningún apartado en las bases por el que queden excluidos. Además, en el apartado de comprobación de datos pone que se comprobarán de oficio los siguientes:
"a)
DNI/NIE de la persona solicitante.
b) DNI/NIE de la persona representante.
c) NIF de la entidad solicitante.
d) NIF de la entidad representante.
(...)"
Pero mejor llama al teléfono
900 815 151 y que te confirmen. Yo suelo llamar y contestan.